Genomikirjasto vs. cDNA-kirjasto
Sisältö
- Sisältö: Ero genomiikan ja cDNA-kirjaston välillä
- Vertailutaulukko
- Mikä on genomiikan kirjasto?
- Mikä on cDNA-kirjasto?
- Keskeiset erot
Genomikirjastoa ja cDNA-kirjastoa käytetään kumpikin geenikloonauksessa erilaisten DNA: ien eristämiseksi. Ero näiden molempien kirjastojen välillä on se, että genomikirjastossa on DNA-fragmentteja, jotka ilmentävät organismin koko genomia, kun taas cDNA-kirjastossa mRNA otetaan organismin tietyistä soluista, ja sitten cDNA koostuu tästä mRNA: sta reaktiossa, joka katalysoidaan entsyymin avulla.
Sisältö: Ero genomiikan ja cDNA-kirjaston välillä
- Vertailutaulukko
- Mikä on genomiikan kirjasto?
- Mikä on cDNA-kirjasto?
- Keskeiset erot
Vertailutaulukko
Perusta | Genomiikkakirjasto | cDNA-kirjasto |
Määritelmä | Genomikirjasto on kokoelma yhden organismin täydellistä genomista DNA: ta. DNA: ta varastoidaan samanlaisten vektorien populaatiossa, joista kukin sisältää erillisen DNA-insertin. | CDNA-kirjasto on kloonattujen cDNA-fragmenttien sekoitus, joka on insertoitu valikoimaan isäntäsoluja, mikä yhdessä muodostaa osan organismin transkriptiosta. |
Ilmaisu | Koko genomi | Vain tietyt geenit. |
Koko | Suurempi | pienemmät |
intronit | nykyinen | Poissa |
Vektori | Se käyttää plasmideja, kosmidia, lambdafaagia, YAC: ta ja BAC: ta suurten fragmenttien sijoittamiseen. | Siinä ei ole introneja, joten siinä käytetään plasmideja, fageideja, lambdafaagia vaatimaton fragmenttien sijoittamiseksi. |
Mikä on genomiikan kirjasto?
Geenikloonausmenettelyssä mielenkiinnon kohteena oleva geeni kopioidaan organismista erotetusta DNA: sta. Kun DNA erotetaan organismista, sen geenit on uutettu kerrallaan. Organismin DNA käsittää tuhansia erilaisia geenejä. Geenisuunnittelija löytää yhden spesifisen geenin, joka koodaa tiettyä kiinnostavaa proteiinia.
Ei ole mitään menetelmää, jolla tietty DNA: n geeni olisi saatavissa, joten tutkijat tekevät geenikirjastoja organismin DNA: n luetteloimiseksi. Tutkijat valitsevat sitten haluamasi geenin kirjastosta. Geenikirjasto on ryhmä eläviä bakteeripesäkkeitä, jotka on transformoitu ainutlaatuisilla DNA-paloilla organismissa, joka on halutun geenin alkuperä. DNA uutetaan organismista rakentamaan kirjasto, joka on DNA: n järjestäytynyt muoto. Genomikirjasto ja cDNA ovat kahden tyyppisiä geenikirjastoja. Rekombinanttitekniikassa geenistrategioina on käytetty lukuisia geenikloonaustekniikoita.
DNA-fragmentit erotetaan leikkaamalla spesifisillä restriktioentsyymeillä lähtö-DNA: sta. Nämä fragmentit ligoidaan vektorimolekyyleihin ja kertyneet molekyylit siirretään isäntäsoluihin, 1 molekyyli jokaisessa solussa. Genomikirjasto koostuu introneista, roskaa DNA: sta ja joukosta muita fragmentteja. Tässä kirjastossa DNA hajotetaan pienempiin fragmentteihin solun sisällä. Tämän jälkeen kaikki pienet osat lisätään vektoriin kirjaston luomiseksi. Genomikirjasto käsittää koko geenien kaiken DNA: n ja solu koostuu kaikista niiden introneista. Genomi-DNA on koko genomin translaatio. Se ei koodaa koko osaa yhdellä kodonilla intronien koon vuoksi. Genomikirjastossa ei ole silmukointimekanismia, joka aiheuttaisi vaikeuksia tästä kirjastosta otettujen geenien ilmentymisessä.
Mikä on cDNA-kirjasto?
cDNA-kirjasto rakennetaan valitsemalla yksi kudos- tai solutyyppi. Myöhemmin mRNA eristetään kyseisestä kudoksesta tai solusta. MRNA-molekyylin DNA-kopio koostuu spesifisestä entsyymistä käänteiskopioijaentsyymi. Joten cDNA-kirjasto sisältää sen spesifisen DNA: n, joka on läsnä mRNA: ssa. Tätä kirjastoa ei löydy introneista eikä DNA-sekvensseistä. Tässä kirjastossa kaikki kloonit ovat täysipitkiä. Lisäksi cDNA-klooni on välttämätön solujen transfektoimiseksi proteiinituotannossa tai solupohjaisissa määrityksissä.
Keskeiset erot
- Genomikirjasto kirjoitettiin suoraan genomisesta DNA: sta.
- cDNA-kirjasto muodostettiin käyttämällä mRNA: ta templaattina.
- Genomikirjastossa on tämän organismin koko genomi.
- cDNA-kirjasto edustaa vain tiettyjen vaivojen geenejä.
- Kaksi entsyymiä, restriktioendonukleaasit ja ligaasit ovat tärkeitä genomikirjaston rakentamiselle.
- Käänteisellä transkriptaasientsyymillä on merkittävä rooli cDNA-kirjaston rakentamisessa.
- Genomikirjastossa on sekä prokaryoottisten että eukaryoottisten organismien DNA.
- cDNA-kirjasto edustaa vain eukaryoottisten organismien DNA: ta.
- cDNA-kirjasto kykenee genomiekspressioon bakteereissa, jotka ovat prokaryoottisia, koska niistä puuttuu introneja.
- Genomikirjasto ei pysty sanomaan prokaryoottisessa organismissa, koska niissä on introneja ja prokaryoottisissa organismeissa ei ole koneita intronien käsittelemiseen.