Genomikirjasto vs. cDNA-kirjasto

Kirjoittaja: Laura McKinney
Luomispäivä: 6 Huhtikuu 2021
Päivityspäivä: 12 Saattaa 2024
Anonim
Genomikirjasto vs. cDNA-kirjasto - Terveys
Genomikirjasto vs. cDNA-kirjasto - Terveys

Sisältö

Genomikirjastoa ja cDNA-kirjastoa käytetään kumpikin geenikloonauksessa erilaisten DNA: ien eristämiseksi. Ero näiden molempien kirjastojen välillä on se, että genomikirjastossa on DNA-fragmentteja, jotka ilmentävät organismin koko genomia, kun taas cDNA-kirjastossa mRNA otetaan organismin tietyistä soluista, ja sitten cDNA koostuu tästä mRNA: sta reaktiossa, joka katalysoidaan entsyymin avulla.


Sisältö: Ero genomiikan ja cDNA-kirjaston välillä

  • Vertailutaulukko
  • Mikä on genomiikan kirjasto?
  • Mikä on cDNA-kirjasto?
  • Keskeiset erot

Vertailutaulukko

PerustaGenomiikkakirjastocDNA-kirjasto
MääritelmäGenomikirjasto on kokoelma yhden organismin täydellistä genomista DNA: ta. DNA: ta varastoidaan samanlaisten vektorien populaatiossa, joista kukin sisältää erillisen DNA-insertin.CDNA-kirjasto on kloonattujen cDNA-fragmenttien sekoitus, joka on insertoitu valikoimaan isäntäsoluja, mikä yhdessä muodostaa osan organismin transkriptiosta.
IlmaisuKoko genomiVain tietyt geenit.
KokoSuurempipienemmät
intronitnykyinenPoissa
VektoriSe käyttää plasmideja, kosmidia, lambdafaagia, YAC: ta ja BAC: ta suurten fragmenttien sijoittamiseen.Siinä ei ole introneja, joten siinä käytetään plasmideja, fageideja, lambdafaagia vaatimaton fragmenttien sijoittamiseksi.

Mikä on genomiikan kirjasto?

Geenikloonausmenettelyssä mielenkiinnon kohteena oleva geeni kopioidaan organismista erotetusta DNA: sta. Kun DNA erotetaan organismista, sen geenit on uutettu kerrallaan. Organismin DNA käsittää tuhansia erilaisia ​​geenejä. Geenisuunnittelija löytää yhden spesifisen geenin, joka koodaa tiettyä kiinnostavaa proteiinia.


Ei ole mitään menetelmää, jolla tietty DNA: n geeni olisi saatavissa, joten tutkijat tekevät geenikirjastoja organismin DNA: n luetteloimiseksi. Tutkijat valitsevat sitten haluamasi geenin kirjastosta. Geenikirjasto on ryhmä eläviä bakteeripesäkkeitä, jotka on transformoitu ainutlaatuisilla DNA-paloilla organismissa, joka on halutun geenin alkuperä. DNA uutetaan organismista rakentamaan kirjasto, joka on DNA: n järjestäytynyt muoto. Genomikirjasto ja cDNA ovat kahden tyyppisiä geenikirjastoja. Rekombinanttitekniikassa geenistrategioina on käytetty lukuisia geenikloonaustekniikoita.

DNA-fragmentit erotetaan leikkaamalla spesifisillä restriktioentsyymeillä lähtö-DNA: sta. Nämä fragmentit ligoidaan vektorimolekyyleihin ja kertyneet molekyylit siirretään isäntäsoluihin, 1 molekyyli jokaisessa solussa. Genomikirjasto koostuu introneista, roskaa DNA: sta ja joukosta muita fragmentteja. Tässä kirjastossa DNA hajotetaan pienempiin fragmentteihin solun sisällä. Tämän jälkeen kaikki pienet osat lisätään vektoriin kirjaston luomiseksi. Genomikirjasto käsittää koko geenien kaiken DNA: n ja solu koostuu kaikista niiden introneista. Genomi-DNA on koko genomin translaatio. Se ei koodaa koko osaa yhdellä kodonilla intronien koon vuoksi. Genomikirjastossa ei ole silmukointimekanismia, joka aiheuttaisi vaikeuksia tästä kirjastosta otettujen geenien ilmentymisessä.


Mikä on cDNA-kirjasto?

cDNA-kirjasto rakennetaan valitsemalla yksi kudos- tai solutyyppi. Myöhemmin mRNA eristetään kyseisestä kudoksesta tai solusta. MRNA-molekyylin DNA-kopio koostuu spesifisestä entsyymistä käänteiskopioijaentsyymi. Joten cDNA-kirjasto sisältää sen spesifisen DNA: n, joka on läsnä mRNA: ssa. Tätä kirjastoa ei löydy introneista eikä DNA-sekvensseistä. Tässä kirjastossa kaikki kloonit ovat täysipitkiä. Lisäksi cDNA-klooni on välttämätön solujen transfektoimiseksi proteiinituotannossa tai solupohjaisissa määrityksissä.

Keskeiset erot

  1. Genomikirjasto kirjoitettiin suoraan genomisesta DNA: sta.
  2. cDNA-kirjasto muodostettiin käyttämällä mRNA: ta templaattina.
  3. Genomikirjastossa on tämän organismin koko genomi.
  4. cDNA-kirjasto edustaa vain tiettyjen vaivojen geenejä.
  5. Kaksi entsyymiä, restriktioendonukleaasit ja ligaasit ovat tärkeitä genomikirjaston rakentamiselle.
  6. Käänteisellä transkriptaasientsyymillä on merkittävä rooli cDNA-kirjaston rakentamisessa.
  7. Genomikirjastossa on sekä prokaryoottisten että eukaryoottisten organismien DNA.
  8. cDNA-kirjasto edustaa vain eukaryoottisten organismien DNA: ta.
  9. cDNA-kirjasto kykenee genomiekspressioon bakteereissa, jotka ovat prokaryoottisia, koska niistä puuttuu introneja.
  10. Genomikirjasto ei pysty sanomaan prokaryoottisessa organismissa, koska niissä on introneja ja prokaryoottisissa organismeissa ei ole koneita intronien käsittelemiseen.